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师生迁至西安，其余的部分则留在上海。于是，交通大学分为了西安和上海两个部分。1959年7月，国务院批准交通大学两部分独立建校，分别成立了上海交通大学和西安交通大学。此时上海交通大学有19个专业，西安交通大学有23个专业。

1961年，上海交通大学划归国防科工委，同时接受高等###和上海市政府领导，此时的学科体系局限于造船等相关专业。文革期间，上海交通大学的正常教学科研秩序遭到严重破坏，发展几近停顿。1970年，学校又划归当时的中国海军领导。文化大革命结束后，上海交通大学率先在中国高校中进行改革，同时拓展专业方向，重建数学、物理、化学、力学等应用理科系以及管理学科，逐步恢复交通大学时期理、工、管三足鼎立的学科布局。

1982年9月，上海交通大学重新划归###领导，后被国务院确定为全国重点建设的大学之一。学校的蓬勃发展使得原有校区日渐紧张，上海交通大学于1985年开始在上海市闵行区兴建闵行校区并于1987年投入使用。20世纪90年代以后，上海交通大学先后获得“211”工程和“985”工程支持，被列为中国创建世界一流大学的少数几所高校之一。1999年，原上海农学院并入。2002年10月，经###批准，上海交通大学在新加坡成立了中国在海外的第一个研究生院。2005年7月，上海交通大学与上海第二医科大学正式合并，组建成新的上海交通大学，成为以工、医、商见长的国内顶尖大学之一。

国际影响

改革开放以来，上海交通大学与国外及港澳台地区的150多所院校、数十家跨国企业以及世界卫生组织、联合国人口基金会等建立了密切合作，先后聘请了400多位国际著名专家学者担任名誉教授、顾问教授和客座教授。与密西根大学等世界著名大学开展了的实质性合作办学；经###批准在新加坡成立了国内高校在海外的第一个研究生院；与Intel、IBM等诸多知名企业和研究机构联合共建了50余个高水平实验室，每年举办数十个国际学术会议。

师资力量

上海交通大学现有专任教师2800余名，其中正高级专业技术职务的700余人，中国科学院院士15人、中国工程院院士20人，“973”首席科学家7人，国家“长江学者奖励计划”特聘教授31人，“长江学者奖励计划”讲座教授4人，国家杰出青年科学基金获得者33人，国家级教学名师2人；有博士学位的教师占50％。

著名系科

学校有20个学院、2个直属系和1个研究生院以及其他教育机构。拥有本科专业60个，一级学科博士学位授权点22个，二级学科博士授权点143个、硕士授权点179个，专业硕士学位授权点6个，博士后流动站23个；国家重点学科22个，上海市重点学科36个；有国家级教学基地和人才培养基地7个。有国家重点实验室6个，国家部委重点实验室10个，上海市重点实验室14个，上海市E研究院3个；国家工程研究中心4个，国家技术转移中心1个，世界卫生组织合作中心2个。

硬件设施

目前上海交通大学有闵行、徐汇、法华、七宝、上中路、重庆南路（原上海第二医科大学）等6个校区，校园总面积近350万平方米；学校图书馆藏书约260万余册。

大家英才

知名人士：蔡锷、蔡元培、丁关根、何祚庥、侯绍裘、黄炎培、黄万里、###、李叔同、林同炎、凌鸿勋、陆定一、茅以升、钱学森、邵力子、王安、汪道涵、汪耕、吴文俊、吴有训、吴稚辉、张光斗、杨嘉墀、张维、朱物华、邹韬奋等。在我国23位“两弹一星”功臣中，交大校友有6位；在中国科学院、中国工程院院士中，交大校友有200多位。

功勋校长

盛宣怀：1896年—1905年；

杨士琦：1905年—1907年；

唐文治：1907年—1920年；

叶恭绰：1921年—1922年；

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上海交通大学（3）

凌鸿勋：1924年—1927年；

蔡元培：1928年—1928年；

孙 科：1928年—1930年；

黎照环：1930年—1944年；

吴有训：1949年—1952年；

彭 康：1952年—1968年。